Gianbattista Scugugia è nato a Olbia il 7 ottobre 1970. Dopo l’esordio con la squadra della sua città (avvenuto nella stagione 1987/1988 ndr) il difensore sardo ha peregrinato in giro per l’Italia maturando esperienze con le maglie di Perugia, Siena e Cesena.
Nel 1996 fa ritorno nella terra natìa. Il Cagliari di Gregorio Perez lo ingaggia dal Cesena per arricchire il reparto difensivo, in uno scambio che vede il portiere Valerio Fiori accasarsi al club romagnolo.
Scugugia rimane in rossoblù solo due stagioni, vivendo in prima persona pure lo spareggio di Napoli contro il Piacenza che condannò il Cagliari alla retrocessione in serie B.
Al termine della Serie B 1997/1998, infatti, il classe 1970 si trasferisce al Siena per iniziare una nuova vita in Toscana.
Scugugia ha totalizzato appena ventidue presenze con la maglia del Cagliari.